TY - JOUR AU - O'Brien, C. AU - Henrich, P. P. AU - Passi, N. AU - Fidock, D. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Recent clinical and molecular insights into emerging artemisinin resistance in Plasmodium falciparum JO - Curr Opin Infect Dis VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QCO.0b013e32834cd3ed DO - 10.1097/QCO.0b013e32834cd3ed ID - O'Brien2011 ER - TY - JOUR AU - Dondorp, A. M. AU - Nosten, F. AU - Yi, P. AU - Das, D. AU - Phyo, A. P. AU - Tarning, J. AU - Lwin, K. M. AU - Ariey, F. AU - Hanpithakpong, W. AU - Lee, S. J. AU - Ringwald, P. AU - Silamut, K. AU - Imwong, M. AU - Chotivanich, K. AU - Lim, P. AU - Herdman, T. AU - An, S. S. AU - Yeung, S. AU - Singhasivanon, P. AU - Day, N. P. AU - Lindegardh, N. AU - Socheat, D. AU - White, N. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Artemisinin resistance in Plasmodium falciparum malaria JO - N Engl J Med VL - 361 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa0808859 DO - 10.1056/NEJMoa0808859 ID - Dondorp2009 ER - TY - JOUR AU - Aurrecoechea, C. AU - Brestelli, J. AU - Brunk, B. P. AU - Dommer, J. AU - Fischer, S. AU - Gajria, B. AU - Gao, X. AU - Gingle, A. AU - Grant, G. AU - Harb, O. S. AU - Heiges, M. AU - Innamorato, F. AU - Iodice, J. AU - Kissinger, J. C. AU - Kraemer, E. AU - Li, W. AU - Miller, J. A. AU - Nayak, V. AU - Pennington, C. AU - Pinney, D. F. AU - Roos, D. S. AU - Ross, C. AU - Stoeckert, C. J. AU - Treatman, C. AU - Wang, H. PY - 2009 DA - 2009// TI - PlasmoDB: a functional genomic database for malaria parasites JO - Nucleic Acids Res VL - 37 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn814 DO - 10.1093/nar/gkn814 ID - Aurrecoechea2009 ER - TY - JOUR AU - Aguero, F. AU - Al-Lazikani, B. AU - Aslett, M. AU - Berriman, M. AU - Buckner, F. S. AU - Campbell, R. K. AU - Carmona, S. AU - Carruthers, I. M. AU - Chan, A. W. AU - Chen, F. AU - Crowther, G. J. AU - Doyle, M. A. AU - Hertz-Fowler, C. AU - Hopkins, A. L. AU - McAllister, G. AU - Nwaka, S. AU - Overington, J. P. AU - Pain, A. AU - Paolini, G. V. AU - Pieper, U. AU - Ralph, S. A. AU - Riechers, A. AU - Roos, D. S. AU - Sali, A. AU - Shanmugam, D. AU - Suzuki, T. AU - Van Voorhis, W. C. AU - Verlinde, C. L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genomic-scale prioritization of drug targets: the TDR Targets database JO - Nat Rev Drug Discov VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrd2684 DO - 10.1038/nrd2684 ID - Aguero2008 ER - TY - JOUR AU - Date, S. V. AU - Stoeckert, C. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Computational modeling of the Plasmodium falciparum interactome reveals protein function on a genome-wide scale JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.4573206 DO - 10.1101/gr.4573206 ID - Date2006 ER - TY - JOUR AU - Orti, L. AU - Carbajo, R. J. AU - Pieper, U. AU - Eswar, N. AU - Maurer, S. M. AU - Rai, A. K. AU - Taylor, G. AU - Todd, M. H. AU - Pineda-Lucena, A. AU - Sali, A. AU - Marti-Renom, M. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - A kernel for open source drug discovery in tropical diseases JO - PLoS Negl Trop Dis VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0000418 DO - 10.1371/journal.pntd.0000418 ID - Orti2009 ER - TY - JOUR AU - Joubert, F. AU - Harrison, C. M. AU - Koegelenberg, R. J. AU - Odendaal, C. J. AU - de Beer, T. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Discovery: an interactive resource for the rational selection and comparison of putative drug target proteins in malaria JO - Malar J VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-8-178 DO - 10.1186/1475-2875-8-178 ID - Joubert2009 ER - TY - JOUR AU - Jensen, K. AU - Plichta, D. AU - Panagiotou, G. AU - Kouskoumvekaki, I. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mapping the genome of Plasmodium falciparum on the drug-like chemical space reveals novel anti-malarial targets and potential drug leads JO - Mol Biosyst VL - 8 UR - https://doi.org/10.1039/c2mb00008c DO - 10.1039/c2mb00008c ID - Jensen2012 ER - TY - JOUR AU - Taboureau, O. AU - Nielsen, S. K. AU - Audouze, K. AU - Weinhold, N. AU - Edsgard, D. AU - Roque, F. S. AU - Kouskoumvekaki, I. AU - Bora, A. AU - Curpan, R. AU - Jensen, T. S. AU - Brunak, S. AU - Oprea, T. I. PY - 2011 DA - 2011// TI - ChemProt: a disease chemical biology database JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq906 DO - 10.1093/nar/gkq906 ID - Taboureau2011 ER - TY - JOUR AU - Flicek, P. AU - Amode, M. R. AU - Barrell, D. AU - Beal, K. AU - Brent, S. AU - Carvalho-Silva, D. AU - Clapham, P. AU - Coates, G. AU - Fairley, S. AU - Fitzgerald, S. AU - Gil, L. AU - Gordon, L. AU - Hendrix, M. AU - Hourlier, T. AU - Johnson, N. AU - Kahari, A. K. AU - Keefe, D. AU - Keenan, S. AU - Kinsella, R. AU - Komorowska, M. AU - Koscielny, G. AU - Kulesha, E. AU - Larsson, P. AU - Longden, I. AU - McLaren, W. AU - Muffato, M. AU - Overduin, B. AU - Pignatelli, M. AU - Pritchard, B. AU - Riat, H. S. AU - Ritchie, G. R. AU - Ruffier, M. AU - Schuster, M. AU - Sobral, D. AU - Tang, Y. A. AU - Taylor, K. AU - Trevanion, S. AU - Vandrovcova, J. AU - White, S. AU - Wilson, M. AU - Wilder, S. P. AU - Aken, B. L. AU - Birney, E. AU - Cunningham, F. AU - Dunham, I. AU - Durbin, R. AU - Fernandez-Suarez, X. M. AU - Harrow, J. AU - Herrero, J. AU - Hubbard, T. J. AU - Parker, A. AU - Proctor, G. AU - Spudich, G. AU - Vogel, J. AU - Yates, A. AU - Zadissa, A. AU - Searle, S. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Ensembl 2012 JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr991 DO - 10.1093/nar/gkr991 ID - Flicek2012 ER - TY - JOUR AU - Megy, K. AU - Emrich, S. J. AU - Lawson, D. AU - Campbell, D. AU - Dialynas, E. AU - Hughes, D. S. AU - Koscielny, G. AU - Louis, C. AU - Maccallum, R. M. AU - Redmond, S. N. AU - Sheehan, A. AU - Topalis, P. AU - Wilson, D. PY - 2012 DA - 2012// TI - VectorBase: improvements to a bioinformatics resource for invertebrate vector genomics JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr1089 DO - 10.1093/nar/gkr1089 ID - Megy2012 ER - TY - JOUR AU - Magrane, M. AU - Consortium, U. PY - 2011 DA - 2011// TI - UniProt Knowledgebase: a hub of integrated protein data JO - Database (Oxford) VL - 2011 UR - https://doi.org/10.1093/database/bar009 DO - 10.1093/database/bar009 ID - Magrane2011 ER - TY - JOUR AU - Dimmer, E. C. AU - Huntley, R. P. AU - Alam-Faruque, Y. AU - Sawford, T. AU - O'Donovan, C. AU - Martin, M. J. AU - Bely, B. AU - Browne, P. AU - Mun Chan, W. AU - Eberhardt, R. AU - Gardner, M. AU - Laiho, K. AU - Legge, D. AU - Magrane, M. AU - Pichler, K. AU - Poggioli, D. AU - Sehra, H. AU - Auchincloss, A. AU - Axelsen, K. AU - Blatter, M. C. AU - Boutet, E. AU - Braconi-Quintaje, S. AU - Breuza, L. AU - Bridge, A. AU - Coudert, E. AU - Estreicher, A. AU - Famiglietti, L. AU - Ferro-Rojas, S. AU - Feuermann, M. AU - Gos, A. AU - Gruaz-Gumowski, N. AU - Hinz, U. AU - Hulo, C. AU - James, J. AU - Jimenez, S. AU - Jungo, F. AU - Keller, G. AU - Lemercier, P. AU - Lieberherr, D. AU - Masson, P. AU - Moinat, M. AU - Pedruzzi, I. AU - Poux, S. AU - Rivoire, C. AU - Roechert, B. AU - Schneider, M. AU - Stutz, A. AU - Sundaram, S. AU - Tognolli, M. AU - Bougueleret, L. AU - Argoud-Puy, G. AU - Cusin, I. AU - Duek-Roggli, P. AU - Xenarios, I. AU - Apweiler, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - The UniProt-GO Annotation database in 2011 JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr1048 DO - 10.1093/nar/gkr1048 ID - Dimmer2012 ER - TY - JOUR AU - Ashburner, M. AU - Ball, C. A. AU - Blake, J. A. AU - Botstein, D. AU - Butler, H. AU - Cherry, J. M. AU - Davis, A. P. AU - Dolinski, K. AU - Dwight, S. S. AU - Eppig, J. T. AU - Harris, M. A. AU - Hill, D. P. AU - Issel-Tarver, L. AU - Kasarskis, A. AU - Lewis, S. AU - Matese, J. C. AU - Richardson, J. E. AU - Ringwald, M. AU - Rubin, G. M. AU - Sherlock, G. PY - 2000 DA - 2000// TI - Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium JO - Nat Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/75556 DO - 10.1038/75556 ID - Ashburner2000 ER - TY - JOUR AU - Kanehisa, M. AU - Goto, S. AU - Sato, Y. AU - Furumichi, M. AU - Tanabe, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - KEGG for integration and interpretation of large-scale molecular data sets JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr988 DO - 10.1093/nar/gkr988 ID - Kanehisa2012 ER - TY - JOUR AU - Carbon, S. AU - Ireland, A. AU - Mungall, C. J. AU - Shu, S. AU - Marshall, B. AU - Lewis, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - AmiGO: online access to ontology and annotation data JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn615 DO - 10.1093/bioinformatics/btn615 ID - Carbon2009 ER - TY - CHAP AU - Fischer, S. AU - Brunk, B. P. AU - Chen, F. AU - Gao, X. AU - Harb, O. S. AU - Iodice, J. B. AU - Shanmugam, D. AU - Roos, D. S. AU - Stoeckert, C. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Using OrthoMCL to assign proteins to OrthoMCL-DB groups or to cluster proteomes into new ortholog groups BT - Curr Protoc Bioinformatics ID - Fischer2011 ER - TY - JOUR AU - Hunter, S. AU - Jones, P. AU - Mitchell, A. AU - Apweiler, R. AU - Attwood, T. K. AU - Bateman, A. AU - Bernard, T. AU - Binns, D. AU - Bork, P. AU - Burge, S. AU - de Castro, E. AU - Coggill, P. AU - Corbett, M. AU - Das, U. AU - Daugherty, L. AU - Duquenne, L. AU - Finn, R. D. AU - Fraser, M. AU - Gough, J. AU - Haft, D. AU - Hulo, N. AU - Kahn, D. AU - Kelly, E. AU - Letunic, I. AU - Lonsdale, D. AU - Lopez, R. AU - Madera, M. AU - Maslen, J. AU - McAnulla, C. AU - McDowall, J. AU - McMenamin, C. AU - Mi, H. AU - Mutowo-Muellenet, P. AU - Mulder, N. AU - Natale, D. AU - Orengo, C. AU - Pesseat, S. AU - Punta, M. AU - Quinn, A. F. AU - Rivoire, C. AU - Sangrador-Vegas, A. AU - Selengut, J. D. AU - Sigrist, C. J. AU - Scheremetjew, M. AU - Tate, J. AU - Thimmajanarthanan, M. AU - Thomas, P. D. AU - Wu, C. H. AU - Yeats, C. AU - Yong, S. Y. PY - 2012 DA - 2012// TI - InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr948 DO - 10.1093/nar/gkr948 ID - Hunter2012 ER - TY - JOUR AU - Pieper, U. AU - Webb, B. M. AU - Barkan, D. T. AU - Schneidman-Duhovny, D. AU - Schlessinger, A. AU - Braberg, H. AU - Yang, Z. AU - Meng, E. C. AU - Pettersen, E. F. AU - Huang, C. C. AU - Datta, R. S. AU - Sampathkumar, P. AU - Madhusudhan, M. S. AU - Sjolander, K. AU - Ferrin, T. E. AU - Burley, S. K. AU - Sali, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - ModBase, a database of annotated comparative protein structure models, and associated resources JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1091 DO - 10.1093/nar/gkq1091 ID - Pieper2011 ER - TY - JOUR AU - Ginsburg, H. AU - Tilley, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Plasmodium falciparum metabolic pathways (MPMP) project upgraded with a database of subcellular locations of gene products JO - Trends Parasitol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2011.03.001 DO - 10.1016/j.pt.2011.03.001 ID - Ginsburg2011 ER - TY - JOUR AU - Croft, D. AU - O'Kelly, G. AU - Wu, G. AU - Haw, R. AU - Gillespie, M. AU - Matthews, L. AU - Caudy, M. AU - Garapati, P. AU - Gopinath, G. AU - Jassal, B. AU - Jupe, S. AU - Kalatskaya, I. AU - Mahajan, S. AU - May, B. AU - Ndegwa, N. AU - Schmidt, E. AU - Shamovsky, V. AU - Yung, C. AU - Birney, E. AU - Hermjakob, H. AU - D'Eustachio, P. AU - Stein, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Reactome: a database of reactions, pathways and biological processes JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1018 DO - 10.1093/nar/gkq1018 ID - Croft2011 ER - TY - JOUR AU - Bairoch, A. PY - 2000 DA - 2000// TI - The ENZYME database in 2000 JO - Nucleic Acids Res VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/nar/28.1.304 DO - 10.1093/nar/28.1.304 ID - Bairoch2000 ER - TY - JOUR AU - Scheer, M. AU - Grote, A. AU - Chang, A. AU - Schomburg, I. AU - Munaretto, C. AU - Rother, M. AU - Sohngen, C. AU - Stelzer, M. AU - Thiele, J. AU - Schomburg, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - BRENDA, the enzyme information system in 2011 JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1089 DO - 10.1093/nar/gkq1089 ID - Scheer2011 ER - TY - STD TI - DrugEBIlity: [https://www.ebi.ac.uk/chembl/drugebility/] UR - https://www.ebi.ac.uk/chembl/drugebility/ ID - ref24 ER - TY - JOUR AU - Bozdech, Z. AU - Llinas, M. AU - Pulliam, B. L. AU - Wong, E. D. AU - Zhu, J. AU - DeRisi, J. L. PY - 2003 DA - 2003// TI - The transcriptome of the intraerythrocytic developmental cycle of Plasmodium falciparum JO - PLoS Biol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0000005 DO - 10.1371/journal.pbio.0000005 ID - Bozdech2003 ER - TY - JOUR AU - Aho, A. AU - Corasick, M. PY - 1975 DA - 1975// TI - Efficient string matching: An aid to bibliographic search JO - Comm ACM VL - 18 UR - https://doi.org/10.1145/360825.360855 DO - 10.1145/360825.360855 ID - Aho1975 ER - TY - JOUR AU - Shuto, S. AU - Minakawa, N. AU - Niizuma, S. AU - Kim, H. S. AU - Wataya, Y. AU - Matsuda, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - New neplanocin analogues. 12. Alternative synthesis and antimalarial effect of (6'R)-6'-C-methylneplanocin A, a potent AdoHcy hydrolase inhibitor JO - J Med Chem VL - 45 UR - https://doi.org/10.1021/jm010374i DO - 10.1021/jm010374i ID - Shuto2002 ER - TY - JOUR AU - Creedon, K. A. AU - Rathod, P. K. AU - Wellems, T. E. PY - 1994 DA - 1994// TI - Plasmodium falciparum S-adenosylhomocysteine hydrolase. cDNA identification, predicted protein sequence, and expression in Escherichia coli JO - J Biol Chem VL - 269 ID - Creedon1994 ER - TY - JOUR AU - Lipinski, C. A. AU - Lombardo, F. AU - Dominy, B. W. AU - Feeney, P. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings JO - Adv Drug Deliv Rev VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/S0169-409X(96)00423-1 DO - 10.1016/S0169-409X(96)00423-1 ID - Lipinski1997 ER -