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Table 4 Tandem repeat variant types in dhps

From: Prevalence of drug resistance associated mutations in Plasmodium vivax against sulphadoxine-pyrimethamine in southern Pakistan

Types

No. of repeats

Amino acid polymorphisms

(Insertions/deletions)

1a

5

GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- ------- ------- GDAKLTN GDSKLTN GEAKLTN

1b

5

GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- ------- ------- GDAKLTN GDSKLTN GEV KLTNK

2a

6

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- ------- GDSKLTN GEAKLTN

2b

6

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- GDAKLTN------- GEAKLTN

2c

6

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- GDAKLTN GDSKLTN -------

2d

6

GEAKLTN ------- GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- GDAKLTN GDSKLTN GEV KLTN

3a

7

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------- ------- GDAKLTN GDSKLTN GEAKLTN

3b

7

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN ------- ------- GDSKLTN GEAKLTN

3c

7

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------ ------ GDAKLTD GDSKLTN GEAKLTN

4a

8

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GDAKLTN ------- GEAKLTN

4b

8

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GDAKLTN GDSKLTN -------

4c

8

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN ------ ------ GDAKLTN GDSKLTN GDSKLTN GEAKLTN

5a

9

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GDAKLTN GDSKLTN GEAKLTN

6a

11

GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GEAKLTN GEGKLTN GDAKLTN GDSKLTN GEAKLTN

  1. Bold face represents a novel substitution of amino acid residue at the designated codon position.
  2. Underline represents insertion and ------ represents deletion of amino acid residues at the respective codon position.
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Malaria Journal

ISSN: 1475-2875

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