TY - JOUR AU - Trape, J. F. AU - Pison, G. AU - Preziosi, M. P. AU - Enel, C. AU - Desgrées du Loû, A. AU - Delaunay, V. AU - Samb, B. AU - Lagarde, E. AU - Molez, J. F. AU - Simondon, F. PY - 1998 DA - 1998// TI - Impact of chloroquine resistance on malaria mortality JO - Med Sci VL - 321 ID - Trape1998 ER - TY - JOUR AU - Carter, R. AU - Mendis, K. N. PY - 2002 DA - 2002// TI - Evolutionary and historical aspects of the burden of malaria JO - Clin Microbiol Rev VL - 15 UR - https://doi.org/10.1128/CMR.15.4.564-594.2002 DO - 10.1128/CMR.15.4.564-594.2002 ID - Carter2002 ER - TY - BOOK PY - 2013 DA - 2013// TI - World Malaria Report 2013 PB - World Health Organization CY - Geneva ID - ref3 ER - TY - JOUR AU - Dondorp, A. M. AU - Nosten, F. AU - Yi, P. AU - Das, D. AU - Phyo, A. P. AU - Tarning, J. AU - Lwin, K. M. AU - Ariey, F. AU - Hanpithakpong, W. AU - Lee, S. J. AU - Ringwald, P. AU - Silamut, K. AU - Imwong, M. AU - Chotivanich, K. AU - Lim, P. AU - Herdman, T. AU - An, S. S. AU - Yeung, S. AU - Singhasivanon, P. AU - Day, N. P. J. AU - Lindegardh, N. AU - Socheat, D. AU - White, N. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Artemisinin resistance in Plasmodium falciparum malaria JO - N Engl J Med VL - 361 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa0808859 DO - 10.1056/NEJMoa0808859 ID - Dondorp2009 ER - TY - JOUR AU - Phyo, A. P. AU - Nkhoma, S. AU - Stepniewska, K. AU - Ashley, E. A. AU - Nair, S. AU - McGready, R. AU - Ler Moo, C. AU - Al-Saai, S. AU - Dondorp, A. M. AU - Lwin, K. M. AU - Singhasivanon, P. AU - Day, N. P. AU - White, N. J. AU - Anderson, T. J. AU - Nosten, F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Emergence of artemisinin-resistant malaria on the western border of Thailand: a longitudinal study JO - Lancet VL - 2012 ID - Phyo2012 ER - TY - JOUR AU - Tran, T. H. AU - Nguyen, T. T. -. N. AU - Nguyen, H. P. AU - Boni, M. F. AU - Ngo, V. T. AU - Nguyen, T. N. -. C. AU - Le, H. T. AU - Cao, Q. T. AU - Pham, V. T. AU - Phung, D. T. AU - Le, T. L. AU - Le, T. D. AU - Merson, L. AU - Dolecek, C. AU - Stepniewska, K. AU - Ringwald, P. AU - White, N. J. AU - Farrar, J. AU - Wolbers, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - In vivo susceptibility of Plasmodium falciparum to artesunate in Binh Phuoc Province, Vietnam JO - Malar J VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-11-355 DO - 10.1186/1475-2875-11-355 ID - Tran2012 ER - TY - STD TI - Update on artemisinin resistance - April 2012.http://www.who.int/malaria/publications/atoz/updateartemsininresistanceapr2012/en/index.html, UR - http://www.who.int/malaria/publications/atoz/updateartemsininresistanceapr2012/en/index.html ID - ref7 ER - TY - JOUR AU - Kyaw, M. P. AU - Nyunt, M. H. AU - Chit, K. AU - Aye, M. M. AU - Aye, K. H. AU - Lindegardh, N. AU - Tarning, J. AU - Imwong, M. AU - Jacob, C. G. AU - Rasmussen, C. AU - Perin, J. AU - Ringwald, P. AU - Nyunt, M. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Reduced susceptibility of Plasmodium falciparum to artesunate in Southern Myanmar JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0057689 DO - 10.1371/journal.pone.0057689 ID - Kyaw2013 ER - TY - STD TI - The status of drug-resistant malaria along the Thailand-Myanmar border.http://www.who.int/malaria/publications/atoz/drug_resistance_myanmar_thailand_border_may_2012.pdf, UR - http://www.who.int/malaria/publications/atoz/drug_resistance_myanmar_thailand_border_may_2012.pdf ID - ref9 ER - TY - JOUR AU - Plowe, C. V. PY - 2003 DA - 2003// TI - Monitoring antimalarial drug resistance: making the most of the tools at hand JO - J Exp Biol VL - 206 UR - https://doi.org/10.1242/jeb.00658 DO - 10.1242/jeb.00658 ID - Plowe2003 ER - TY - JOUR AU - Hastings, I. AU - Smith, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - MalHaploFreq: A computer programme for estimating malaria haplotype frequencies from blood samples JO - Malar J VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-7-130 DO - 10.1186/1475-2875-7-130 ID - Hastings2008 ER - TY - JOUR AU - Schoepflin, S. AU - Valsangiacomo, F. AU - Lin, E. AU - Kiniboro, B. AU - Mueller, I. AU - Felger, I. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparison of Plasmodium falciparum allelic frequency distribution in different endemic settings by high-resolution genotyping JO - Malar J VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-8-250 DO - 10.1186/1475-2875-8-250 ID - Schoepflin2009 ER - TY - JOUR AU - Ako, B. A. AU - Offianan, A. T. AU - Johansson, M. AU - Penali, L. K. AU - Nguetta, S. -. P. A. AU - Sibley, C. H. PY - 2012 DA - 2012// TI - Molecular analysis of markers associated with chloroquine and sulfadoxine/pyrimethamine resistance in Plasmodium falciparum malaria parasites from southeastern Côte-d ’Ivoire by the time of artemisinin-based combination therapy adoption in 2005 JO - Infect Drug Resist VL - 5 UR - https://doi.org/10.2147/IDR.S31409 DO - 10.2147/IDR.S31409 ID - Ako2012 ER - TY - JOUR AU - Cowman, A. F. AU - Morry, M. J. AU - Biggs, B. A. AU - Cross, G. A. AU - Foote, S. J. PY - 1988 DA - 1988// TI - Amino acid changes linked to pyrimethamine resistance in the dihydrofolate reductase-thymidylate synthase gene of Plasmodium falciparum JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 85 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.85.23.9109 DO - 10.1073/pnas.85.23.9109 ID - Cowman1988 ER - TY - JOUR AU - Brooks, D. R. AU - Wang, P. AU - Read, M. AU - Watkins, W. M. AU - Sims, P. F. AU - Hyde, J. E. PY - 1994 DA - 1994// TI - Sequence variation of the hydroxymethyldihydropterin pyrophosphokinase: dihydropteroate synthase gene in lines of the human malaria parasite, Plasmodium falciparum, with differing resistance to sulfadoxine JO - Eur J Biochem VL - 224 UR - https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1994.00397.x DO - 10.1111/j.1432-1033.1994.00397.x ID - Brooks1994 ER - TY - JOUR AU - Peterson, D. S. AU - Walliker, D. AU - Wellems, T. E. PY - 1988 DA - 1988// TI - Evidence that a point mutation in dihydrofolate reductase-thymidylate synthase confers resistance to pyrimethamine in falciparum malaria JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 85 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.85.23.9114 DO - 10.1073/pnas.85.23.9114 ID - Peterson1988 ER - TY - JOUR AU - Olliaro, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Mode of action and mechanisms of resistance for antimalarial drugs JO - Pharmacol Ther VL - 89 UR - https://doi.org/10.1016/S0163-7258(00)00115-7 DO - 10.1016/S0163-7258(00)00115-7 ID - Olliaro2001 ER - TY - JOUR AU - Gregson, A. AU - Plowe, C. V. PY - 2005 DA - 2005// TI - Mechanisms of resistance of malaria parasites to antifolates JO - Pharmacol Rev VL - 57 UR - https://doi.org/10.1124/pr.57.1.4 DO - 10.1124/pr.57.1.4 ID - Gregson2005 ER - TY - STD TI - Country antimalarial drug policies: by region.http://www.who.int/malaria/am_drug_policies_by_region_emro/en/index.html, UR - http://www.who.int/malaria/am_drug_policies_by_region_emro/en/index.html ID - ref19 ER - TY - BOOK PY - 2012 DA - 2012// TI - World Malaria Report 2012 PB - World Health Organization CY - Geneva ID - ref20 ER - TY - BOOK AU - Warrell, D. A. AU - Gilles, H. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Essential Malariology PB - Arnold CY - London ID - Warrell2002 ER - TY - JOUR AU - Hastings, I. M. AU - Nsanzabana, C. AU - Smith, T. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - A comparison of methods to detect and quantify the markers of antimalarial drug resistance JO - Am J Trop Med Hyg VL - 83 UR - https://doi.org/10.4269/ajtmh.2010.10-0072 DO - 10.4269/ajtmh.2010.10-0072 ID - Hastings2010 ER - TY - JOUR AU - Malisa, A. AU - Pearce, R. AU - Mutayoba, B. AU - Abdullah, S. AU - Mshinda, H. AU - Kachur, P. AU - Bloland, P. AU - Roper, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Quantification of markers of antimalarial drug resistance from an area of high malaria transmission: Comparing frequency with prevalence JO - African J Biotechnol VL - 11 UR - https://doi.org/10.5897/AJB12.1487 DO - 10.5897/AJB12.1487 ID - Malisa2012 ER - TY - JOUR AU - Hill, W. G. AU - Babiker, H. PY - 1995 DA - 1995// TI - Estimation of numbers of malaria clones in blood samples JO - Proc Biol Sci VL - 262 UR - https://doi.org/10.1098/rspb.1995.0203 DO - 10.1098/rspb.1995.0203 ID - Hill1995 ER - TY - JOUR AU - Li, X. AU - Foulkes, A. S. AU - Yucel, R. M. AU - Rich, S. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - An expectation maximization approach to estimate malaria haplotype frequencies in multiply infected children JO - Stat Appl Genet Mol Biol VL - 6 ID - Li2007 ER - TY - JOUR AU - Wigger, L. AU - Vogt, J. E. AU - Roth, V. PY - 2013 DA - 2013// TI - Malaria haplotype frequency estimation JO - Stat Med VL - 32 UR - https://doi.org/10.1002/sim.5792 DO - 10.1002/sim.5792 ID - Wigger2013 ER - TY - JOUR AU - Kum, C. K. AU - Thorburn, D. AU - Ghilagaber, G. AU - Gil, P. AU - Björkman, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - On the effects of malaria treatment on parasite drug resistance–probability modelling of genotyped malaria infections JO - Int J Biostat VL - 9 UR - https://doi.org/10.1515/ijb-2012-0016 DO - 10.1515/ijb-2012-0016 ID - Kum2013 ER - TY - BOOK AU - Gelman, A. AU - Carlin, J. B. AU - Stern, H. S. AU - Rubin, D. B. PY - 2004 DA - 2004// TI - Bayesian Data Analysis PB - CRC Press CY - Boca Raton, London, New York, Washington, D.C ID - Gelman2004 ER - TY - BOOK AU - Albert, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Bayesian Computation with R PB - Springer CY - Dordrecht Heidelberg London New York UR - https://doi.org/10.1007/978-0-387-92298-0 DO - 10.1007/978-0-387-92298-0 ID - Albert2009 ER - TY - CHAP PY - 2013 DA - 2013// BT - R: A language and environment for statistical computing ID - ref30 ER - TY - JOUR AU - Francis, D. AU - Nsobya, S. L. AU - Talisuna, A. AU - Yeka, A. AU - Kamya, M. R. AU - Machekano, R. AU - Dokomajilar, C. AU - Rosenthal, P. J. AU - Dorsey, G. PY - 2006 DA - 2006// TI - Geographic differences in antimalarial drug efficacy in Uganda are explained by differences in endemicity and not by known molecular markers of drug resistance JO - J Infect Dis VL - 193 UR - https://doi.org/10.1086/500951 DO - 10.1086/500951 ID - Francis2006 ER - TY - JOUR AU - Lozovsky, E. R. AU - Chookajorn, T. AU - Brown, K. M. AU - Imwong, M. AU - Shaw, P. J. AU - Kamchonwongpaisan, S. AU - Neafsey, D. E. AU - Weinreich, D. M. AU - Hartl, D. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Stepwise acquisition of pyrimethamine resistance in the malaria parasite JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0905922106 DO - 10.1073/pnas.0905922106 ID - Lozovsky2009 ER - TY - JOUR AU - Roper, C. AU - Pearce, R. AU - Nair, S. AU - Sharp, B. AU - Nosten, F. AU - Anderson, T. PY - 2004 DA - 2004// TI - Intercontinental spread of pyrimethamine-resistant malaria JO - Science VL - 305 UR - https://doi.org/10.1126/science.1098876 DO - 10.1126/science.1098876 ID - Roper2004 ER - TY - JOUR AU - Pearce, R. J. AU - Pota, H. AU - Evehe, M. -. S. AU - Bâ, E. -. H. AU - Mombo-Ngoma, G. AU - Malisa, A. L. AU - Ord, R. AU - Inojosa, W. AU - Matondo, A. AU - Diallo, D. A. AU - Mbacham, W. AU - Van den, B. AU - Swarthout, T. D. AU - Getachew, A. AU - Dejene, S. AU - Grobusch, M. P. AU - Njie, F. AU - Dunyo, S. AU - Kweku, M. AU - Owusu-Agyei, S. AU - Chandramohan, D. AU - Bonnet, M. AU - Guthmann, J. -. P. AU - Clarke, S. AU - Barnes, K. I. AU - Streat, E. AU - Katokele, S. T. AU - Uusiku, P. AU - Agboghoroma, C. O. AU - Elegba, O. Y. PY - 2009 DA - 2009// TI - Multiple origins and regional dispersal of resistant dhps in African Plasmodium falciparum malaria JO - PLoS Med VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1000055 DO - 10.1371/journal.pmed.1000055 ID - Pearce2009 ER - TY - JOUR AU - Naidoo, I. AU - Roper, C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Mapping “partially resistant”, “fully resistant”, and “super resistant” malaria JO - Trends Parasitol VL - 29 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2013.08.002 DO - 10.1016/j.pt.2013.08.002 ID - Naidoo2013 ER - TY - JOUR AU - Kublin, J. G. AU - Dzinjalamala, F. K. AU - Kamwendo, D. D. AU - Malkin, E. M. AU - Cortese, J. F. AU - Martino, L. M. AU - Mukadam, R. G. AU - Rogerson, S. J. AU - Lescano, A. G. AU - Molyneux, M. E. AU - Winstanley, P. A. AU - Chimpeni, P. AU - Taylor, T. E. AU - Plowe, C. V. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular markers for failure of sulfadoxine-pyrimethamine and chlorproguanil-dapsone treatment of Plasmodium falciparum malaria JO - J Infect Dis VL - 185 UR - https://doi.org/10.1086/338566 DO - 10.1086/338566 ID - Kublin2002 ER - TY - JOUR AU - Ariey, F. AU - Witkowski, B. AU - Amaratunga, C. AU - Beghain, J. AU - Langlois, A. -. C. AU - Khim, N. AU - Kim, S. AU - Duru, V. AU - Bouchier, C. AU - Ma, L. AU - Lim, P. AU - Leang, R. AU - Duong, S. AU - Sreng, S. AU - Suon, S. AU - Chuor, C. M. AU - Bout, D. M. AU - Ménard, S. AU - Rogers, W. O. AU - Genton, B. AU - Fandeur, T. AU - Miotto, O. AU - Ringwald, P. AU - Le Bras, J. AU - Berry, A. AU - Barale, J. -. C. AU - Fairhurst, R. M. AU - Benoit-Vical, F. AU - Mercereau-Puijalon, O. AU - Ménard, D. PY - 2014 DA - 2014// TI - A molecular marker of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum malaria JO - Nature VL - 505 UR - https://doi.org/10.1038/nature12876 DO - 10.1038/nature12876 ID - Ariey2014 ER -