Table 4 Species specific sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of microscopy compared with HVUSqPCR parasite detection
qPCR pos micro pos | qPCR pos micro neg | qPCR neg micro neg | qPCR neg micro pos | Total | Sensitivity (95 % CI) | Specificity (95 % CI) | Positive predictive value (95 % CI) | Negative predictive value (95 % CI) | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pf | |||||||||
All sites | 62 | 144 | 4616 | 5 | 4827 | 30 % (24–37 %) | 100 % (99–100 %) | 93 % (83–98 %) | 97 % (96–97 %) |
Cam | 0 | 36 | 1410 | 1 | 1447 | 0 % (0–10 %) | 100 % (99–100 %) | 0 % (0–10 %) | 98 % (97–98 %) |
TMBA | 37 | 61 | 1418 | 1 | 1517 | 38 % (28–48 %) | 100 % (99–100 %) | 98 % (86–100 %) | 96 % (95–97 %) |
Viet | 25 | 47 | 1788 | 3 | 1863 | 35 % (24–47 %) | 100 % (99–100 %) | 89 % (72–98 %) | 97 % (97–98 %) |
Pv | |||||||||
All sites | 141 | 262 | 4411 | 13 | 4827 | 35 % (30–40 %) | 100 % (99–100 %) | 92 % (86–95 %) | 94 % (94–95 %) |
Cam | 7 | 45 | 1395 | 0 | 1447 | 14 % (6–26 %) | 100 % (99–100 %) | 100 % (59–100 %) | 97 % (96–98 %) |
TMBA | 99 | 149 | 1264 | 5 | 1517 | 40 % (34–46 %) | 100 % (99–100 %) | 95 % (89–98 % | 89 % (89–91 %) |
Viet | 35 | 68 | 1752 | 8 | 1863 | 34 % (25–44 %) | 100 % (99–100 %) | 81 % (67–92 %) | 96 % (95–97 %) |
P. spp | |||||||||
All sites | 13 | 391 | 3864 | 1 | 4269 | 3 % (2–5 %) | 100 % (99–100 %) | 93 % (66–100 %) | 91 % (90–92 %) |
Cam | 0 | 145 | 1218 | 0 | 1363 | 0 % (0–0.3 %) | 100 % (97–100 %) | NA | 89 % (88–91 %) |
TMBA | 6 | 175 | 1009 | 0 | 1190 | 3 % (1–7 %) | 100 % (99–100 %) | 100 % (54–100 %) | 85 % (83–87 %) |
Viet | 7 | 71 | 1637 | 1 | 1716 | 9 % (4–18 %) | 100 % (99–100 %) | 88 % (47–100 %) | 96 % (95–97 %) |