Skip to main content

Table 1 Number and prevalence of Plasmodium falciparum polymorphisms pre- and post-treatment and post-treatment selection

From: Selection of Plasmodium falciparum pfcrt and pfmdr1 polymorphisms after treatment with artesunate–amodiaquine fixed dose combination or artemether–lumefantrine in Liberia

Genotype Pre-treatment Post-treatment
ASAQ-FDC AL
Recrudescences Reinfections Recrudescences Reinfections
pfcrt 76
 K 19 6.5 % 0 0.0 % 2 3.3 % 1 16.7 % 12*** 31.6 %
 K/T 7 2.4 % 0 0.0 % 3 5.0 % 0 0.0 % 1 2.6 %
 T 268 91.2 % 2 100.0 % 55 91.7 % 5 83.3 % 25 65.8 %
pfmdr1 86
 N 90 30.6 % 1 50.0 % 12 19.7 % 4 66.7 % 28*** 70.0 %
 N/Y 47 16.0 % 0 0.0 % 8 13.1 % 1 16.7 % 3 7.5 %
 Y 157 53.4 % 1 50.0 % 41 67.2 % 1 16.7 % 9 22.5 %
pfmdr1 184
 Y 166 56.5 % 1 50.0 % 33 55.9 % 3 50.0 % 24 55.8 %
 Y/F 24 8.2 % 1 50.0 % 2 3.4 % 1 16.7 % 2 4.7 %
 F 104 35.4 % 0 0.0 % 24 40.7 % 2 33.3 % 17 39.5 %
pfmdr1 1246
 D 181 61.6 % 2 66.7 % 29 48.3 % 5 83.3 % 33 76.7 %
 D/Y 58 19.7 % 1 33.3 % 7 11.7 % 0 0.0 % 2 4.7 %
 Y 55 18.7 % 0 0.0 % 24** 40.0 % 1 16.7 % 8 18.6 %
pfmrp1 876
 I 285 96.9 % 2 100.0 % 59 96.7 % 6 100.0 % 42 97.7 %
 I/V 7 2.4 % 0 0.0 % 1 1.6 % 0 0.0 % 0 0.0 %
 V 2 0.7 % 0 0.0 % 1 1.6 % 0 0.0 % 1 2.3 %
pfmrp1 1466
 K 283 96.3 % 3 100.0 % 60 100.0 % 6 100.0 % 40 100.0 %
 K/R 4 1.4 % 0 0.0 % 0 0.0 % 0 0.0 % 0 0.0 %
 R 7 2.4 % 0 0.0 % 0 0.0 % 0 0.0 % 0 0.0 %
pfmdr1 86 + 184 + 1246 a
 NYD 55 27.8 % 1 100.0 % 5 10.2 % 2 40.0 % 15 42.9 %
 NYY 0 0 % 0 0 % 2* 4.1 % 0 0 % 1 2.9 %
 NFD 29 14.6 % 0 0.0 % 4 8.2 % 2 40.0 % 10* 28.6 %
 YFD 54 27.3 % 0 0.0 % 15 30.6 % 0 0.0 % 1 2.9 %
 YYY 47 23.7 % 0 0.0 % 20* 40.8 % 1 20.0 % 5 14.3 %
 Othersb 13 6.6 % 0 0.0 % 3 6.1 % 0 0.0 % 3 8.6 %
  1. Number and prevalence of polymorphisms selected post-treatment are in italics
  2. * p ≤ 0.05, ** p < 0.001, *** p < 0.0001
  3. a Haplotype prevalence excluding mixed genotype infections
  4. b YYD, NFY, YFY