| Ankazomborona | Matanga | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | Pre-treatment | Post-treatment | Pre-treatment | Post-treatment | ||||
 | AL n (%) | ASAQ n (%) | AL n (%) | ASAQ n (%) | AL n (%) | ASAQ n (%) | AL n (%) | ASAQ n (%) |
 | N = 15 | N = 16 | N = 1 | N = 0 | N = 29 | N = 21 | N = 10 | N = 3 |
SNPs, codon 86 | ||||||||
 N86 | 10 (67) | 12 (75) | 1 (100) | (0) 0 | 26 (90) | 16 (76) | 9 (90) | 3 (100) |
 86 N/Y | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (10) | 0 (0) | 0 (0) |
 86Y | 5 (33) | 4 (25) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (10) | 3 (14) | 1 (10) | 0 (0) |
 | N = 16 | N = 16 | N = 1 | N = 0 | N = 29 | N = 21 | N = 10 | N = 3 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNPs, codon 184 | ||||||||
 Y184 | 2 (12) | 10 (63) | 1(100) | 0 (0) | 15 (52) | 7 (33) | 5 (50) | 2 (67) |
 184Y/F | 0 (0) | 1(6) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (10) | 3 (14) | 0 (0) | 0 (0) |
 184F | 14 (88) | 5 (31) | 0 (0) | 0 (0) | 11 (38) | 11 (52) | 5 (50) | 1 (33) |
 | N = 15 | N = 15 | N = 1 | N = 0 | N = 28 | N = 19 | N = 10 | N = 4 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 SNPs, codon 1246 | ||||||||
 D1246 | 13 (87) | 14 (93) | 1 (100) | 0 (0) | 28 (100) | 18 (95) | 10 (100) | 4 (100) |
 1246D/Y | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
 1246Y | 2 (13) | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (5) | 0 (0) | 0 (0) |
 | N = 15 | N = 14 | N = 1 | N = 0 | N = 27 | N = 18 | N = 10 | N = 3 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Haplotypes†| ||||||||
 NYD | 0 (0) | 8 (57) | 1 (100) | 0 (0) | 15 (56) | 7 (39) | 5 (50) | 2 (67) |
 YFD | 2 (13) | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (17) | 1 (10) | 0 (0) |
 NFD | 10 (67) | 4 (29) | 0 (0) | 0 (0) | 12 (44) | 11 (61) | 4 (40) | 1 (33) |
 NFY | 0 (0) | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (6) | 0 (0) | 0 (0) |
 NYY | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
 YYD | 1 (7) | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (11) | 3 (17) | 0 (0) | 0 (0) |
 YFY | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
 YYY | 1 (7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |