Genus/species | Primer name | Primer sequence | PCR product length (bp) | Denaturation | Annealing | Elongation | No of cycles |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Plasmodium | F | TTAAAATTGTTGCAGTTAAAACG | 1200 bp | 95 °C, 1 min | 53 °C, 0.75 min | 72 °C, 1.5 min | 35 |
R | CCTGTTGTTGCCTTAAACTTC | Â | |||||
P. falciparum | F | TTAAACTGGTTTGGGAAAACCAAATATATT | 205 bp | 95 °C, 1 min | 58 °C, 0.75 min | 72 °C, 1 min | 35 |
R | ACACAATGAACTCAATCATGACTACCCGTC | Â | |||||
P. vivax | F | CGCTTCTAGCTTAATCCACATAACTGATAC | 112 bp | 95 °C, 1 min | 60 °C, 1 min | 72 °C, 1 min | 35 |
R | ACTTCCAAGCCGAAGCAAAGAAAG TCCTTA | Â | |||||
P. malariae | F | ATAACATAGTTGTACGTTAAGAATAACCGC | 144 bp | 95 °C, 1 min | 58 °C, 0.75 min | 72 °C, 1 min | 35 |
R | AAAATTCCCATGCATAAAAAATTATACAAA | Â | |||||
P. ovale | F | ATCTCTTTTGCTATTTTTTAGTATTGGAGA | 800 bp | 95 °C, 1 min | 60 °C, 1 min | 72 °C, 1 min | 35 |
R | GGAAAAGGACACATTAATTGTATCCTAGTG | Â |