Gene/locus | Primer name | Primer sequences (5'-3') | Annealing Tm (°C) |
---|---|---|---|
18S SSU rRNA | SSU-F | ATGAACGAGATCTTAACCTGC | 65/55 |
 | SSU-R | CATCACGATATGTA5TGATAAAGATTACC |  |
MiniSat-1 | Mini1-F | ATGCTTCATTGGGTCCAC | 50 |
 | Mini1-R | TCGAACAGGACAATGCTG |  |
MiniSat-2 | Mini2-F | TCACCGGTGGGTCCTTCG | 50 |
 | Mini2-R | GCAGCGACGAACCGTCAC |  |
MiniSat-5 | Mini5-F | CAACCTGCAGAGCAATGC | 55 |
 | Mini5-R | ACGTTTCTGGGCGACTTC |  |
MiniSat-6 | Mini6-F | TTGTGCTGTGCTGTGCTG | 55 |
 | Mini6-R | ACGGTTGGTATGGTCAGG |  |
MiniSat-8 | Mini8-F | AGCCACAATCCCAACTGC | 52 |
 | Mini8-R | TGGTGGTTGTGACTCTAG |  |
MiniSat-11 | Mini11-F | GGCACAGTGATCATATTCG | 55 |
 | Mini11-R | GCGGGTACATAACGCATG |  |
MiniSat-13 | Mini13-F | GGCACATGAACTTTTCGG | 52 |
 | Mini13-R | TTCACCATGGTCCCTTCG |  |
MiniSat-14 | Mini14-F | CTCTTCGTCGCGTCCAGG | 52 |
 | Mini14-R | CAGGGTATCCACGACCAG |  |
MiniSat-16 | Mini16-F | TATGTACTACCTCCACCC | 52 |
 | Mini16-R | AGCGCGAATATGCATACG |  |
PvCDPK | CDPK-F | CGCCTCTTTTTCGAGCCC | 55 |
 | CDPK-R | CTGCGCCTTCCGCGTCTT |  |